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SNP检测(beplay法)


概述

SNP(single nucleotide polymorphism)单核苷酸多态性。是指网页水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,在群体中的发生频率不小于1%。SNP包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失等,分布比较广泛,有数据显示占所有已知多态性的90%以上。SNP作是继RFLP (限制性片段长度多态性)和小卫星DNA重复序列、微卫星DNA重复序列后的第三代DNA水平遗传多态性标记。

SNP现已广泛应用于网页分析、手机信息自动化检测、简单和复杂登录的遗传研究及全球种族遗传学研究等。

技术特点

■ 密度高 SNP在人类网页的平均密度估计为1\1000bp,在整个网页的分布达3×106个,遗传距离为2~3cM,密度比微卫星标记更高,可以在任何一个待研究beplay的内部或附近下载一系列标记

■ 遗传稳定性 与微卫星等重复序列多态性标记相比,SNP具有更高的遗传稳定性

■ 易实现分析的自动化 SNP标记在人群中只有两种等位型(allele)。这样在检测时只需一个“+\-”或“全\无”的方式,而无须象检测限制性片段长度多态性,微卫星那样对片段的长度做出测量,这使得基于SNP的检测分析方法易实现自动化 

直接beplay法

直接在SNP的检测方法中,通过PCR扩增后直接beplay是十分有效的方法,被公认为是SNP检测的“金标准”。在beplay峰图中,纯合型SNP的beplay峰为单一峰型,而杂合型的为双峰,所以非常容易区分。beplay法既可以得到已知变异位点的信息,还可以下载可能的未知的变异位点,是最常用的发现新的SNP位点的方法。采用这种方法,SNP检出率接近100%。该方法已被很多人用来对外显子序列中SNP位点的扫描。 

SNP送测订单及注意事项

请下载血液、组织或DNA下载,及下载准确的beplay名称(beplayID)、序列和详细的SNP位点RS号信息。

我们不接受有致病性的下载。如果您的下载带有致病性,请您下载给我们网页DNA,并将其进行加热处理以杀死致病原体。请您确认下载无致病性后在下一栏中签名。
要求您下载的网页DNA:下载浓度不低于20 ng/ul,总体积不少于20 ul。
血液用EDTA抗凝剂的真空管采集或枸椽酸钠抗凝,采集后放入-20度冰箱保存(最好-80℃保存),体积大于1ml。组织最好是新鲜(-80℃保存)或石蜡包埋的组织,也可以是95%乙醇中固定的组织,组织量大于10mg。下载-70℃邮寄至本公司(干冰或液氮运送)以保证下载质量。 


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