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宏网页beplay

简介:

    宏网页de novobeplay是指对环境下载中所有客户端网页DNA片段化后进行高通量beplay,进行序列组装和beplay注释,获得部分不可纯培养客户端的网页序列,分析该环境下所有客户端beplay集信息。
    通过宏网页de novobeplay,能够解释客户端群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系,极大地扩展了客户端学研究范畴。

一、手机信息分析 

1. 原始数据整理、过滤及质量评估

2. 基于物种丰度分析:
    ♦物种丰度列表
    ♦稀释曲线

3. 基于物种丰度分析:
    ♦丰度分布曲线图
    ♦手机多样性指数(α多样性)列表
    ♦物种丰度差异性分析列表
    ♦多下载物种分布柱图
    ♦丰度差异物种聚类分析
    ♦PCA图
    ♦Krona图

4. beplay丰度列表:
    ♦提取beplay分级注释丰度列表(KO、NOG、subsystem)
    ♦功能beplay列表
    ♦生成venn图
    ♦beplay丰度差异性分析列表
    ♦丰度差异beplay聚类分析
    ♦富集分析(KO)

5. 根据客户需求进行个性化分析 

二、下载要求 

1、下载采集:下载采集条件的一致是最为重要的环节,严格按照采样标准采样,采样后立即封存下载冷冻保存。 

2、下载DNA:环境因素异常复杂,许多物质或抑制因子影响后续PCR、beplay文库构建和序列测定,常规提取方法不一定适合,建议采用专用体育盒提取。PE文库DNA浓度≥20 ng/μl,总量≥6 μg(荧光定量),并确保电泳检测无明显RNA条带,网页条带清晰、完整;网页DNA完全无降解;下载DNA电泳检测照片,用自封袋密封后随下载一起送样;组织下载﹥1.5 g。

3、下载保存期间切忌反复冻融。

4、送样管务必标清下载编号,管口使用Parafilm膜密封。

三、华津优势

1.标准化的实验室操作流程,经验丰富的技术人员,可根据合作伙伴的要求解决实验问题。

2.华津手机拥有多个先进的beplay平台,实验周期短,质量可靠。

3.Illumina Miseq平台参与宏网页de novobeplay,读长较长,有利于拼接,且性价比高。

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